home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00213 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.4 KB  |  50 lines
  1. ************************************************
  2. * Receptor tyrosine kinase class III signature *
  3. ************************************************
  4.  
  5. A number of growth factors  stimulate mitogenesis by interacting with a family
  6. of   cell  surface receptors which   possess  an  intrinsic, ligand-sensitive,
  7. protein tyrosine kinase activity [1].   These  receptor tyrosine kinases (RTK)
  8. all share the same topology: an  extracellular ligand-binding domain, a single
  9. transmembrane  region and a cytoplasmic  kinase domain.   However  they can be
  10. classified into at least five groups.   The class III RTK's are  characterized
  11. by the  presence  of  five  to  seven immunoglobulin-like domains [2] in their
  12. extracellular section. Their kinase domain differs from that of other RTK's by
  13. the insertion of a stretch of 70 to 100 hydrophilic residues in  the middle of
  14. this domain. The receptors currently known to belong to class III are:
  15.  
  16.  - Platelet-derived growth factor receptor (PDGF-R).  PDGF-R exists as a homo-
  17.    or heterodimer of two related chains: alpha and beta [3].
  18.  - Macrophage colony stimulating factor receptor (CSF-1-R)  (also known as the
  19.    fms oncogene).
  20.  - Stem cell factor (mast cell growth factor) receptor  (also known as the kit
  21.    oncogene).
  22.  - Vascular  endothelial  growth  factor  (VEGF) receptors Flt-1 and Flk-1/KDR
  23.    [4].
  24.  - Fl cytokine receptor Flk-2/Flt-3 [5].
  25.  - The putative receptor Flt-4 [7].
  26.  
  27. We developed  a  signature pattern for this class of RTK's which is based on a
  28. conserved region in the kinase domain.
  29.  
  30. -Consensus pattern: G-x-H-x-N-[LIVM]-V-N-L-L-G-A-C-T
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  32. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  33. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  34.  
  35. [ 1] Yarden Y., Ullrich A.
  36.      Annu. Rev. Biochem. 57:443-478(1988).
  37. [ 2] Hunkapiller T., Hood L.
  38.      Adv. Immunol. 44:1-63(1989).
  39. [ 3] Lee K.-H., Bowen-Pope D.F., Reed R.R.
  40.      Mol. Cell. Biol. 10:2237-2246(1990).
  41. [ 4] Terman B.I., Dougher-Vermazen M., Carrion M.E., Dimitrov D.,
  42.      Armellino D.C., Gospodarowicz D., Boehlen P.
  43.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 187:1579-1586(1992).
  44. [ 5] Lyman S.D., James L., Vanden Bos T., de Vries P., Brasel K., Gliniak B.,
  45.      Hollingsworth L.T., Picha K.S., McKenna H.J., Splett R.R.
  46.      Cell 75:1157-1167(1993).
  47. [ 6] Galland F., Karamysheva A., Pebusque M.J., Borg J.P., Rottapel R.,
  48.      Dubreuil P., Rosnet O., Birnbaum D.
  49.      Oncogene 8:1233-1240(1993).
  50.